Increasing Power by Sharing Information from Genetic Background and Treatment in Clustering of Gene Expression Time Series

الملخص

هذا البحث يطوير طريقة تجميع جديدة تسمح لكل مجموعة لتكون بارامتريسد وفقا لما إذا كان سلوك الجينات عبر الظروف مترابطة أو غير مترابطة. من خلال تحديد الارتباط بين هذه الجينات، والمزيد من المعلومات هو كسب داخل المجموعة حول كيفية الجينات المترابطة. التصلب الجانبي الضموري (ألس) هو اضطراب عصبي لا رجعة فيه يقتل الخلايا العصبية الحركية ويؤدي إلى الموت في غضون 2-3 سنوات من بداية الأعراض. سرعة التقدم لمرضى مختلفة غير متجانسة مع تباين كبير. أظهرت الفئران المعدلة وراثيا SOD1G93A من خلفيات مختلفة (129Sv و C57) الاختلافات الظواهر ثابتة لتطور المرض. التسلسل الهرمي للعمليات الغوسية المستخدمة لتشكيل نموذجية محددة وجينات محددة التباين المشترك بين الجينات. وأظهرت هذه الدراسة حول العثور على بعض ملامح التعبير الجيني هامة ومجموعات من تعبيرات الجينات المرتبطة أو المشتركة معا من أربع مجموعات من البيانات (SOD1G93A و نتغ من 129Sv و C57 الخلفيات). وتظهر دراستنا فعالية تبادل المعلومات بين المكررات وظروف نموذج مختلفة عند النمذجة الجينات سلسلة الوقت التعبير. المزيد من الجينات إثراء تحليل النتيجة وتحليل مسار الأنطولوجيا من بعض المجموعات المحددة لمجموعة معينة قد يؤدي نحو تحديد الميزات الكامنة وراء سرعة التفاضلية تطور المرض.